一是焚烧干枯水草或稻杆。河流、池塘、水系岸边芦苇、香蒲等水草以及稻田秸秆焚烧不仅毁坏湿地，而且造成大气污染。

    二是湿地取水口设施毁坏。湿地取水口设施长年不用或无人翻修而失效，很多农村池塘、沟渠和水库修建于上个世纪，随着时间推移，这些取水口设施的储水、输水的功能逐渐失去，造成池塘四季缺水甚至干涸。

    三是乱取水或无节制取水。村民用潜水泵从河流抽水，枯水季竭泽而渔，捕鱼捉虾，使水系的水生动植物多样性急剧减少。

    四是农村湿地污染严重。乱倒生活垃圾、乱排生活污水、超量使用高效化肥和农药以及农业养殖，造成农村湿地点源或面源污染，水系、湖泊富营养化，导致湿地生物锐减，湿地生物多样性减少，最终导致湿地鱼类、水禽及浮游生物死亡。

    五是农村湿地监管缺失。河流、水系、池塘上经常漂浮着死猪、死猫和医疗废弃物等，这些废弃物直接威胁周边人群的健康。

    六是农村湿地乱垦或乱填。围湖造田，滥垦湿地，导致农村湿地调洪、蓄水能力减弱，湿地面积减少。