新疆项目加强了湿地保护综合协调机制建设，成立了新疆GEF“加强阿尔泰山两河源自然保护区有效管理项目”指导委员会，并在阿尔泰山景观层面成立了项目协调领导小组。项目设计的总目标和3个层面的成果以及相应的10项产出均已实现。

项目积极支持发展多种替代产业，增加牧民家庭收入，促进哈萨克牧民从资源的使用者转变为守护者。2018年，妇女刺绣合作社成员年收入1077～2308美元不等，实现自然保护与社区发展的“双赢”。

项目在自治区、阿尔泰山国有林管理局、保护区及周边社区等层面开展各类培训班74期，培训人员2428人次，其中包括生物多样性保护跨行业规划培训14期566人次；为阿尔泰山林业系统及相关保护区专业技术人员举办培训班12期550余人次；为保护区工作人员举办培训班30期915人次；为当地牧民培训18期447人次，总结推广多项牧民替代生计。通过上述培训，显著提升了保护地从业人员及当地牧民湿地保护与可持续利用的意识和能力。

2015年5月， 新疆项目保护地人员在库尔木图进行野外监测

2014年8月， 新疆项目支持以阿肯弹幅方式向牧民宣传生态保护

创建特色生态文明宣教基地，提高了公众保护生态环境的意识。例如，项目支持和帮助当地观鸟、拍鸟人士出版《阿勒泰野鸟》一书，对了解阿勒泰地区鸟类资源具有重要的参考价值，对普及鸟类知识、推动我国的观鸟事业也具有积极意义。

新疆项目还积极开展了跨境野生动物保护国际合作，在蒙古国代表团访问中国阿尔泰山两河源自然保护区期间，2014年双方签署了《中蒙阿勒泰-萨彦生态区域生物多样性保护合作备忘录》；2015年项目专家赴蒙古国进行了河狸调查工作；2016年10月，蒙古国科布多省孟科海尔恒国家公园对中国阿勒泰地区自然保护区建设和生物多样性保护工作进行了考察访问，并就GEF“加强阿尔泰山两河源流域景观保护区有效管理项目”合作事宜进行磋商交流。对跨国界野生动物保护具有重要意义。

此外，于2018年5月启动的阿尔泰山生态保护管理规划项目的设计思路与GEF规划型项目生态保护与建设理念相同，在体制和机制上得到了相关单位的大力支持。项目期间，新疆湿地和国家级自然保护区获得各项补助资金投入90,233,846美元。其中，阿勒泰地区获得20,604,615美元。