截至目前，我省已发现脊椎动物1600多种，约占全国种类的三分之一，其中属国家重点保护的160种。共有鸟类549种，居全国第六位，其中属国家一级保护的有12种，属国家二级保护的84种，属重点保护的62种，属省一般保护的303种。近年来，兴化湾、闽江河口、泉州湾、湄洲湾、三都湾等21个重要湿地已成为众多水禽的栖息地和越冬地，共出现鸟类70多种近11万只，包括国家一级保护鸟类遗鸥，国家二级保护鸟类黑脸琵鹭、卷尾鹈鹕、小天鹅等。