淮安市地处江淮、黄淮两大平原结合部，境内河网密布、湖泊众多，大运河、里运河、古淮河和盐河四水穿城，洪泽湖、高邮湖、白马湖和宝应湖四湖镶嵌，承转下泄淮河上中游16.8万平方公里来水。南北过渡的气候、水网密布的环境，造就了我市丰富的湿地资源和多样的生态系统。全市湿地总面积298.9万亩，占国土面积的19.7%。其中：湖泊湿地129.4万亩，河流湿地43.4万亩，沼泽湿地4.4万亩，人工湿地121.7万亩。

至2015年,全市自然湿地受保护率达49.5%,全省排名第三。目前，淮安市共有省级湿地自然保护区两个，洪泽湖东部省级湿地自然保护区（总面积54000公顷，湿地面积46703.99公顷）和涟漪湖黄嘴白鹭自然保护区（总面积3430公顷，湿地面积29.01公顷）；国家级湿公园（试点）2个，江苏古淮河国家湿地公园（总面积246.40公顷，湿地面积142.61公顷）和江苏淮安白马湖国家级湿地公园（总面积3243.37 hm2公顷，湿地面积3058.12公顷）；省级湿地公园1个，盱眙天泉湖省级湿地公园（总面积1980公顷，湿地面积577.94公顷）。共建湿地保护小区5个，洪泽县入江水道湿地保护小区，总面积1066公顷，湿地面积1066公顷；淮安区白马湖湿地保护小区1500公顷，水面1000公顷；淮阴区古黄河湿地保护小区，总面积301.7公顷，其中湿地面积156.1公顷；涟水县古黄河湿地保护小区，总面积450公顷，其中湿地面积243.6公顷；盱眙县青荷滩湿地保护小区总面积233.3公顷，其中湿地面积69.2公顷。另外，饮用水源地中含受保护自然湿地2024.56公顷，渔业保护区1167.18公顷。