在森林工程建设中，巴南区围绕“一城一江、二山二环、三园三库、四路四河”，进行总体规划，以长江沿岸、水库周围、河流两岸为重点，加强生态建设，在2013-2017年水系绿化率提高到80%以上。

一是加强长江沿岸生态建设。以构建三峡库区屏障为重点，在鱼洞街道、麻柳嘴镇、双河口镇、木洞镇长江沿岸造林4.1万亩，其中，改造长江沿岸低效林3万亩，新建长江生态屏障林1.1万亩，美化桃花岛、南坪坝，巩固建设长江沿岸中日合作造林基地1个。

二是加强水库周围生态建设。以南湖水库、丰岩水库、下涧口水库等三个中型水库为重点，建设水源涵养林、景观林带，造林0.6万亩，其中，水库周边景观绿化带0.5万亩，改造水库周边低效林0.1万亩，打造南湖湿地公园1个。

三是加强河流两岸生态建设。以五步河、鱼溪河、箭滩河、花溪河等四条河流为重点，建设水土保持景观林带，造林5万亩，其中鱼溪河周边景观绿化带0.8万亩，改造溪河周边低质低效林0.25万亩。