东北地理与农业生态研究所植物标本馆始建于1962年，至今有的标本已有40多年的馆藏历史。

建所之初（1958），根据中国科学院地学研究领域的分工，沼泽湿地研究是我所主攻方向之一。四十年来，我所湿地科学工作者足迹遍布全国主要湿地分布区。主持和参加三江平原沼泽荒地资源考察，长白山、大小兴安岭沼泽考察，长江中下游及沿海湿地考察，参加中国科学院青藏高原综合科学考察、以及新疆沼泽湿地考察。他们的足迹到那里，就把那里的湿地植物标本采回来。回所后，一份份标本经过认真分析、鉴定，定好名，收藏在标本柜里。此外，还包括与国外交流时，采到的阿尔巴尼亚、芬兰、加拿大等国的湿地植物标本。我所收藏湿地植物标本约占全国湿地植物标本的70%以上。是我国湿地植物标本最多、最全、最集中的标本室。这对研究我国湿地类型、分布及其生物多样性，都是十分宝贵的实物资料。特别是有些湿地目前已经发生变化甚至已不存在，这些标本则成为仅存的实物佐证。

原标本柜是木质的简易标本柜，经过40余年的使用，有的已经开始损坏变形；另有数千号标本无柜可放，只好堆放在标本室角落里。由于标本室条件差，有些标本已开始发霉变质。如不采取措施，四十余年的科研工作积累有可能全部报废，这无疑是对我国湿地研究的重大损失。