为了不断的积累互花米草治理及栖息地优化的经验，进一步巩固互花米草治理和鸟类栖息地优化的效果，上海崇明东滩鸟类国家级自然保护区在完成捕鱼港互花米草治理一、二期的基础上，于2013年启动了互花米草三期的治理工作。并于2013年底完成三期简易围堰、围区水系、生境岛屿施工，于2014年3月开始对三期进行蓄水，经过近三个月的蓄水，6月底三期平均水位达到60公分以上，为彻底灭除互花米草创造了良好的条件。

  7月初保护区启动了对三期互花米草的带水刈割，除采用人工割除方式外积极尝试改装机械对互花米草进行割除。经试验改装机械割草效率明显高于人工方式且达到要求，目前已割除三期区域内300多亩互花米草。

  在现场检查过程，保护区互花米草治理项目管理人员要求施工方严格按照施工方案进行刈割，保证施工质量。施工期间正值高温季节，施工区域水位较高且地势高低不平，项目管理人员要求施工方加强安全教育作好防暑工作，保证施工安全。