天然湿地丧失导致生态与环境恶化表现在土壤侵蚀加剧和局部沙化，并造成土壤肥力下降。

东北三江平原草甸沼泽土开垦后，土壤水分减少，由嫌气变为好气环境，有机残体分解加快，使得土壤容重和土粒容度增大，孔隙度减小，不合理耕种使土壤变得越来越黏重，导致抗涝和抗旱能力下降。

天然沼泽土壤在常年积水和过湿环境下，积累了大量的有机质，当开垦后，不但停止积累，而且有机质开始分解。开垦初期土壤表层有机残体分解，潜在土壤肥力得到发挥，有利农作物生长。然而掠夺式开发，忽视土壤养分恢复和积累，导致肥力下降。

若尔盖高原湿地区，自1955 年以来累计疏干沼泽约20 万hm2，随着沼泽地排水植物群落发生变化，局部出现沙化。沙化面积由20 世纪60 年代末的9016hm2，扩展到2005 年的41 560hm2，沙漠化面积增加了460%（赵魁义，2000）。